Jean-Pierre Escaffre enseigne le management stratégique, la stratégie technologique et l'économie politique. Co-concepteur de formations spécifiques en R&D pour les industries de l'agro-alimentaire, il a exercé comme professeur à l'Ecole Nationale de la Santé Publique (Rennes), pour la formation des Directeurs d'Hôpitaux publics français. Il est l'un des co-créateurs de l'Association Latine d'Analyse des Systèmes de Santé (ALASS), aujourd'hui étendue à l'Amérique du Sud. Il est aussi membre du conseil scientifique du Centre Collaborateur français de l'OMS (Lille). Enfin, il a collaboré à la création d'Ecoles de Santé Publique à l'étranger, et à l'élaboration des programmes de formation pour les cadres dirigeants.